為了保持集裝箱運(yùn)價(jià)的穩(wěn)定，避免海運(yùn)成本變化導(dǎo)致運(yùn)價(jià)的波動(dòng)，集裝箱班輪運(yùn)輸仍然沿襲了班輪運(yùn)輸?shù)馁M(fèi)率形式，即基本費(fèi)率加附加費(fèi)率。不過無(wú)論是基本費(fèi)率還是附加費(fèi)率，其形式比班輪運(yùn)輸要簡(jiǎn)潔的多。基本費(fèi)率的形式包括均一費(fèi)率（FAK）、包箱費(fèi)率（CBR）。
　　與普通班輪一樣，國(guó)際集裝箱海運(yùn)運(yùn)費(fèi)除計(jì)收基本運(yùn)費(fèi)外，也要加收各種附加費(fèi)。附加費(fèi)的標(biāo)準(zhǔn)與項(xiàng)目，根據(jù)航線和貨種的不同而有不同的規(guī)定。集裝箱海運(yùn)附加費(fèi)通常包括以下幾種形式：港口擁擠附加費(fèi)、變更卸貨港附加費(fèi)、選擇卸貨港附加費(fèi)、燃油附加費(fèi)、貨幣貶值附加費(fèi)等。本文就各船公司通常主要用到的三種附加費(fèi)作一系統(tǒng)地講述。
　　１． 港口擁擠附加費(fèi)（THC）。
　　港口擁擠附加費(fèi)也稱船舶擁擠附加費(fèi)（THC），是對(duì)運(yùn)往卸貨港的貨物因船舶擁擠致使停泊時(shí)間延長(zhǎng)而臨時(shí)征收的附加費(fèi)。這種附加費(fèi)中有按一定數(shù)額計(jì)收的和按運(yùn)費(fèi)的一定百分比來計(jì)收的兩種。船舶擁擠大多發(fā)生在發(fā)展中國(guó)家的港口，主要是由于港口設(shè)備差，進(jìn)口計(jì)劃性不強(qiáng)，政情不穩(wěn)，罷工，怠工，勞動(dòng)熱情低等原因。就運(yùn)費(fèi)的提高而言，一般都由各航運(yùn)公會(huì)公布一個(gè)一定的實(shí)施預(yù)告期，但如果船舶擁擠是偶然引起的，也可根據(jù)公會(huì)應(yīng)急條款（CONTINGENCｙ CLAUSE）的規(guī)定，在沒有預(yù)告的情況下進(jìn)行征收。但是在美國(guó)航運(yùn)界，聯(lián)邦海事局（FEDERAL MARITIME COMMISSION）規(guī)定，即使在這種情況下，也需要至少有一個(gè)月的預(yù)告期。
　　２． 燃油附加費(fèi)（BAF）。
　　一般是指在不得不比一般水平的價(jià)格高或比普通使用的燃油價(jià)格更高的價(jià)格來補(bǔ)給燃油時(shí)（例如因進(jìn)入戰(zhàn)時(shí)體制供油地的油價(jià)高漲，或因象上次石油沖擊那樣的不測(cè)事態(tài)而漲價(jià)等），通常油價(jià)及其差額要轉(zhuǎn)嫁到每一噸貨物或分?jǐn)偟交举M(fèi)率上去。
　　這一附加費(fèi)的計(jì)算方法是，先按平常價(jià)格營(yíng)運(yùn)時(shí)一個(gè)航次的總?cè)剂腺M(fèi)與按漲價(jià)后的總?cè)加唾M(fèi)求出差額，除以船舶裝載能力，計(jì)算出每一載重噸應(yīng)負(fù)擔(dān)的差額。或者，算出上漲價(jià)格比平常價(jià)格上升的比例，并以基本費(fèi)率來除它，就可求出基本費(fèi)率應(yīng)加的百分?jǐn)?shù)了。
　　３． 貨幣貶值附加費(fèi)（CAF）。
　　因?yàn)槎ㄆ诤骄�通常要涉及到使用兩種以上不同貨幣的國(guó)家，所以其運(yùn)費(fèi)率須以較穩(wěn)定的貨幣計(jì)價(jià)，在多數(shù)情況下是以美元為基礎(chǔ)。雖然各國(guó)以一定的匯率與美元等主要貨幣結(jié)算不會(huì)有什么問題，但是如果在主要貨幣的穩(wěn)定性比較差的情況下，公會(huì)所管轄的兩國(guó)以上貨幣的交換就會(huì)產(chǎn)生變化。
　　例如與1美元＝360日元的時(shí)代相比，當(dāng)美元事實(shí)上已貶值到1美元＝308日元或1美元＝276日元時(shí)，船公司從貨主處收取的美元換算成日元以后，在運(yùn)費(fèi)額中每美元分別遭到52日元或84日元的匯兌差額損失。為彌補(bǔ)這種差額損失而征收的費(fèi)用，即所謂貨幣貶值附加費(fèi)。實(shí)際上在貨幣的變動(dòng)幅度不大或會(huì)員船公司并沒有把這種貨幣換成其他貨幣（這時(shí)并沒有發(fā)生差額損失）時(shí)，也有照樣考慮在基本費(fèi)率上增收一定百分?jǐn)?shù)來征收這種附加費(fèi)的。
　　另外，現(xiàn)在以日本為中心的許多公會(huì)，貨幣貶值附加費(fèi)基于貨主的同意，已有了一定的公式，根據(jù)這一公式可以自動(dòng)地計(jì)算出附加費(fèi)率。另外，相對(duì)于主要國(guó)家貨幣的其他貨幣，在其匯率大幅度貶值的情況下，也會(huì)產(chǎn)生負(fù)值的貨幣貶值附加費(fèi)。
　　除上述各項(xiàng)附加費(fèi)外，其他有關(guān)的附加費(fèi)計(jì)收規(guī)定與普通班輪的附加費(fèi)計(jì)收規(guī)定相同。這些附加費(fèi)包括：因港口情況復(fù)雜或出現(xiàn)特殊情況所產(chǎn)生的港口附加費(fèi)PORT ADDITIONAL；因戰(zhàn)爭(zhēng)、運(yùn)河關(guān)閉等原因迫使船舶繞道航行而增收繞航附加費(fèi)DEVIATION SURCHARGE等。此外，對(duì)于貴重貨物，如果托運(yùn)人要求船方承擔(dān)超過提單上規(guī)定的責(zé)任限額時(shí)，船方要增收超額責(zé)任附加費(fèi)ADDITIONAL FOR EXCESS OF LIABILITｙ。
　　需指出的是，隨著世界集裝箱船隊(duì)運(yùn)力供給大于運(yùn)量需求的矛盾越來越突出，集裝箱航運(yùn)市場(chǎng)上銷價(jià)競(jìng)爭(zhēng)的趨勢(shì)日益蔓延，因此，目前各船公司大多減少了附加費(fèi)的征收種類，將許多附加費(fèi)并入運(yùn)價(jià)當(dāng)中，給貨主提供一個(gè)較低的包干運(yùn)價(jià)。這一方面起到了吸引貨源的目的，同時(shí)也簡(jiǎn)化了運(yùn)費(fèi)結(jié)算手續(xù)。