中醫學學科體系的基本結構就學術分類而言，中醫學理論體系的學科群，以基礎與應用分，則可分為基礎學科和應用學科兩大類；以對疾病的認識、治療和預防的醫療行為過程分，則可分為基礎醫學學科、臨床醫學學科和養生康復醫學學科三大類。

　　1.基礎醫學：

　　中醫基礎理論：中醫基礎理論是整個現代中醫學科群的基礎，其主要內容為中醫學的哲學基礎，臟象、經絡、氣血精津液、病因病機，以及預防治則康復等學說。

　　中醫診斷學：中醫診斷學是根據中醫基礎理論研究診法和辨證的理論、知識和方法的一門學科，是聯結理論與臨床診治的橋梁。

　　中藥學：中醫傳統用以預防和診治疾病的藥類物質謂之中藥，又稱本草、草藥、中草藥，現統稱中藥。其主要來源于天然藥物及其加工品，包括植物藥、動物藥、礦物藥及部分化學、生物制品藥。中藥學主要研究中藥的基本理論和各種中藥的來源、采制、性能、功效及應用等，包括中藥藥理學、中成藥學、中藥栽培學、中藥藥材學、中藥炮制學、中藥制劑學、中藥化學等分支。

　　方劑學：方劑，簡稱方。方指醫方，劑指調劑。方劑是根據配伍的原則，以若干藥物配合組成的藥方，是治法的體現，是中醫學理、法、方、藥的重要組成部分醫學教|育網搜集整理；方劑學是研究中醫方劑的組成、變化和臨床應用的一門學科。其內容包括方劑的組成原則、藥物的配伍規律、方劑的組成變化、劑型及方劑的用法等。

　　2.臨床醫學：中醫學關于病證的認識及治療病證的原則、措施和經驗等，構成了中醫應用學科的主體，并分別組合為中醫內科學、中醫外科學、中醫婦科學、中醫兒科學、中醫骨傷科學、中醫五官科學、針灸推拿學''等臨床學科。

　　3.養生康復醫學：中醫養生學是在中醫理論指導下，探索和研究中國傳統的頤養身心、增強體質、預防疾病、延年益壽的理論和方法，并用這種理論和方法指導人們保健活動的應用科學。