邪正的盛衰變化，對于疾病的發生、發展及其變化和轉歸，都有重要的影響。疾病的發生與發展是正氣與邪氣斗爭的過程。正氣充沛，則人體有抗病能力，疾病就會減少或不發生；若正氣不足，疾病就會發生和發展。因此，治療的關鍵就是要改變正邪雙方力量的對比，扶助正氣，祛除邪氣，使疾病向痊愈的方向轉化。
　　
　　扶正：就是使用扶正的藥物或其它方法，以增加體質，提高抗病能力，以達到戰勝疾病、恢復健康的目的。適用于正氣虛為主的疾病，是《內經》“實則瀉之”的運用。臨床上根據不同的病情，有益氣、養血、滋陰、壯陽等不同的方法。
　　
　　祛邪：就是祛除體內的邪氣，達到邪去正復的目的。適用于邪氣為主的疾病，是《內經》“實則瀉之”的運用。臨床上根據不同的病情，而有發表、攻下、清解、消導等不同方法。
　　
　　臨床運用扶正祛邪這一原則，要認真細致地觀察邪正消長的盛衰情況，根據正邪雙方在疾病過程中所處的不同地位，分清主次、先后、靈活地運用。
　　
　　單純扶正僅適用于正虛為主者；單純祛邪僅適用于邪盛為主者，先祛邪后扶正則適用于邪盛而正不甚虛者，先扶正后祛邪則適用于正虛而邪不甚者，扶正與祛邪并用則適用于正虛邪實者，即所謂“攻補兼施”，當然亦需分清是虛多實少，還是實多虛少。若虛多則扶正為主，兼以祛邪，實多則又以祛邪為主，兼以扶正。總之，要以“扶正不留邪，祛邪不傷正”為原則。