手太陽小腸經循行路線起自手小指尺側端，沿手掌尺側緣上行，出尺骨莖突，沿前臂后邊尺側直上，從尺骨鷹嘴和肱骨內上髁之間向上，沿上臂后內側出行到肩關節后，繞肩胛，在大椎穴處（后頸部椎骨隆起處）與督脈相會。

    又向前進入鎖骨上窩，深入體腔，聯絡心臟，沿食道下行，穿膈肌，到胃部，入屬小腸。其分支從鎖骨上窩沿頸上面頰到外眼角，又折回進入耳中。另一支脈從面頰部分出，經眶下，達鼻根部的內眼角，然后斜行到顴部。脈氣由此與足太陽膀胱經相接。本經發生病變，主要表現為咽痛，下頜腫，耳聾，目黃和肩部、上肢后邊內側本經脈過處疼痛等。

    手太陽小腸經為人體十二經脈之一。簡稱小腸經。出《靈樞。經水》。即手太陽小腸經，《靈樞。經脈》：“小腸手太陽之脈，起于小指之端，循手外側上腕，出踝中，直上循臂骨下廉，出肘內側兩筋之間，上循臑外后廉。出肩解，繞肩胛，交肩上，入缺盆，絡心，循咽，下膈，抵胃，屬小腸；其支者，以缺盆循頸上頰，至目脫眥，卻入耳中；其支者，別頰，上（出頁），抵鼻，至目內眥，斜絡于顴。”

    起于小指外側端（少澤穴），沿手背、上肢外側后緣，過肘部，到肩關節后面，繞肩胛部，交肩上（大椎穴）前行入缺盆，絡心，沿食道，穿過膈肌，到達胃部，下行，屬小腸。本經脈一分支是從缺盆出來， 沿頸部上行到面頰，至目外眥后，退行進入耳中（聽宮穴）。另一分支是從面頰部分出，向上行于眼下，至目內眥（睛明穴）交于足太陽膀胱經。

    該經脈腧穴有少澤 、前谷、后溪、腕骨、陽谷、養老、支正、小海、肩貞、臑俞、天宗、秉風、曲垣、肩外俞、肩中俞、天窗、天容、顴髎、聽宮，共19穴，左右合38穴。