通過檢測病原體遺傳物質(zhì)來確認病原體也許是檢查病原體為直接的方法了。目前比較成熟的技術(shù)包括基因探針技術(shù)和PCR技術(shù)。

　　（一）基因探針技術(shù)

　　用標記物標記細菌染色體或質(zhì)粒DNA上的特異性片段制備成細菌探針，待檢標本經(jīng)過短時間培養(yǎng)后，經(jīng)過點膜、裂解變性、預雜交和雜交后，利用探針上標記物發(fā)出的信號可以知道雜交結(jié)果并判斷病原體的性質(zhì)。基因探針技術(shù)操作比較復雜，加之同位素污染等問題，目前尚不能普及應用。近年來發(fā)展起來的地高辛標記的非同位素探針，從探針標記到雜交都很方便，只是價格昂貴，仍限于科研應用，尚不能普及。

　　（二）PCR技術(shù)

　　這是八十年代末發(fā)展起來的一項極有應用價值的技術(shù)，設(shè)計病原體基因的特異引物，細菌標本（不經(jīng)培養(yǎng)）經(jīng)過簡單裂解、變性后，就可在PCR儀上進行擴增反應，經(jīng)過25～30個循環(huán)，通過瓊脂糖電泳即可觀察擴增結(jié)果，檢出病原體。這種技術(shù)的特點是簡便、快速。它尤其適于那些培養(yǎng)時間較長的病原菌的檢查，如結(jié)核桿菌、支原體等。PCR高度的敏感性使該技術(shù)在病原體診斷過程中極易出現(xiàn)假陽性，避免污染是提高PCR診斷準確性的關(guān)鍵環(huán)節(jié)。