1、沙眼衣原體肺炎：胸片顯示雙側廣泛間質和肺泡浸潤，過度充氣征比較常見，偶見大葉實變。周圍血白細胞計數一般正常，嗜酸性粒細胞增多。從鼻咽拭子一定要刮取到上皮細胞。也可用直接熒光抗體試驗（DFA）、酶免疫試驗（EIA）檢測鼻咽標本沙眼衣原體抗原。血清學檢查特異性抗體診斷標準為雙分血清抗體滴度4倍以上升高，或IgM＞1：32，IgG＞1：512.也可應用PCR技術直接檢測衣原體DNA.

　　2、鸚鵡熱衣原體肺炎：胸部X線檢查，從肺門向周邊，特別向下肺野可見毛玻璃樣陰影中間有點狀影。周圍血白細胞數正常，血沉在患病早期稍增快。肺泡滲出液的吞噬細胞內可查見衣原體包涵體。輕癥患兒3～7d發熱漸退。中癥8～～14d，重癥20～25d退熱。病后免疫力減弱，可復發，有報道復發率達21%，再感染率10%左右。

　　3、肺炎衣原體肺炎：白細胞計數正常，胸片無特異性，多為單側下葉浸潤，表現為節段性肺炎，嚴重者呈廣泛雙側肺炎。病原學檢查與沙眼衣原體肺炎一樣，從氣管或鼻咽吸取物做細胞培養，肺炎衣原體陽性。或用熒光結合的肺炎衣原體特異性單克隆抗體來鑒定細胞培養中的肺炎衣原體。PCR檢測肺炎衣原體DNA較培養更敏感，但用咽拭子標本檢測似不夠理想，不如血清學檢測肺炎衣原體特異性抗體。微量免疫熒光（MIF）試驗檢測肺炎衣原體仍最敏感。特異性IgM抗體≥1：16或IgM抗體≥1：512或抗體滴度4倍以上增高，有診斷價值。