臨床上將AIDS的病程分為三個階段：①早期或稱急性期，感染病毒3～6周后可出現咽痛、發熱、肌肉酸痛等一些非特異性表現。病毒在體內復制，但由于患者尚有較好的免疫反應能力，2～3周后這種急性感染癥狀可自行緩解；②中期或稱慢性期，機體的免疫功能與病毒之間處于相互抗衡階段，在某些病例此期可長達數年或不再進入末期。此期病毒復制持續于低水平，臨床可以無明顯癥狀或出現明顯的全身淋巴結腫大，常伴發熱、乏力、皮疹等；③后期或稱危險期，機體免疫功能全面崩潰，病人持續發熱、乏力、消瘦、腹瀉，并出現神經系統癥狀，明顯的機會感染及惡性腫瘤，血液化驗可見淋巴細胞明顯減少（＜30%），CD4＋細胞減少尤為顯著，CD4＋細胞與CD8＋細胞之比可由原來的2下降至0.5以下，細胞免疫反應喪失殆盡。

　　本病的預后差，死亡率達100%，致病原因雖已清楚，但制備有效的疫苗尚有待時日，其困難在于HIV在不同的患者有驚人的多型性，目前又無理想的治療藥物，因此大力開展預防，對防止AIDS流行至關重要。